MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chamaesiphon minutus PCC 6605

Total Repeats: 101117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019697	AT	3	6	2	7	50 %	50 %	0 %	0 %	434384226
2	NC_019697	GCG	2	6	63	68	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434384226
3	NC_019697	AAG	2	6	262	267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434384226
4	NC_019697	GAT	2	6	279	284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384226
5	NC_019697	GCT	2	6	368	373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384226
6	NC_019697	TTA	2	6	387	392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434384226
7	NC_019697	CGA	2	6	515	520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384226
8	NC_019697	GAA	2	6	534	539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434384226
9	NC_019697	AGA	2	6	545	550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434384226
10	NC_019697	AAG	2	6	556	561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434384226
11	NC_019697	AGGC	2	8	685	692	25 %	0 %	50 %	25 %	434384226
12	NC_019697	TCG	2	6	736	741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384226
13	NC_019697	ATTT	2	8	766	773	25 %	75 %	0 %	0 %	434384226
14	NC_019697	A	6	6	774	779	100 %	0 %	0 %	0 %	434384226
15	NC_019697	GTC	2	6	832	837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384226
16	NC_019697	TGG	2	6	854	859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434384226
17	NC_019697	ACG	2	6	865	870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384226
18	NC_019697	TCAA	2	8	886	893	50 %	25 %	0 %	25 %	434384226
19	NC_019697	ATT	2	6	936	941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434384226
20	NC_019697	GCT	2	6	945	950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384226
21	NC_019697	TTA	2	6	981	986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434384226
22	NC_019697	TCGA	2	8	1000	1007	25 %	25 %	25 %	25 %	434384226
23	NC_019697	A	6	6	1074	1079	100 %	0 %	0 %	0 %	434384226
24	NC_019697	GC	3	6	1110	1115	0 %	0 %	50 %	50 %	434384226
25	NC_019697	TGA	2	6	1153	1158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384226
26	NC_019697	AGC	2	6	1163	1168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384226
27	NC_019697	CG	3	6	1178	1183	0 %	0 %	50 %	50 %	434384226
28	NC_019697	AAG	2	6	1192	1197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434384226
29	NC_019697	CGAT	2	8	1225	1232	25 %	25 %	25 %	25 %	434384226
30	NC_019697	TCG	2	6	1318	1323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384226
31	NC_019697	TCG	2	6	1330	1335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384226
32	NC_019697	TCC	2	6	1363	1368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434384226
33	NC_019697	CGGT	2	8	1373	1380	0 %	25 %	50 %	25 %	434384226
34	NC_019697	CGA	3	9	1456	1464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384226
35	NC_019697	AGA	2	6	1481	1486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434384226
36	NC_019697	CTG	2	6	1513	1518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384226
37	NC_019697	GTG	2	6	1525	1530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434384226
38	NC_019697	CGCA	2	8	1553	1560	25 %	0 %	25 %	50 %	434384226
39	NC_019697	GGA	2	6	1628	1633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434384226
40	NC_019697	TCG	2	6	1669	1674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384226
41	NC_019697	CAT	2	6	1683	1688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384226
42	NC_019697	TTA	2	6	1743	1748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434384226
43	NC_019697	ATCG	2	8	1791	1798	25 %	25 %	25 %	25 %	434384226
44	NC_019697	CTAG	2	8	1839	1846	25 %	25 %	25 %	25 %	434384226
45	NC_019697	TAGT	2	8	2276	2283	25 %	50 %	25 %	0 %	434384227
46	NC_019697	TTC	2	6	2346	2351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434384227
47	NC_019697	ACCA	2	8	2395	2402	50 %	0 %	0 %	50 %	434384227
48	NC_019697	AGT	2	6	2439	2444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384227
49	NC_019697	AACA	2	8	2461	2468	75 %	0 %	0 %	25 %	434384227
50	NC_019697	TAA	2	6	2490	2495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384227
51	NC_019697	GTC	2	6	2569	2574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384227
52	NC_019697	GTC	2	6	2593	2598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384227
53	NC_019697	GGC	2	6	2602	2607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434384227
54	NC_019697	TGG	2	6	2628	2633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434384227
55	NC_019697	GCA	3	9	2695	2703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384227
56	NC_019697	TTTTA	2	10	2806	2815	20 %	80 %	0 %	0 %	434384227
57	NC_019697	CAT	2	6	2883	2888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384227
58	NC_019697	CAA	2	6	2899	2904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434384227
59	NC_019697	AAT	2	6	2957	2962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384227
60	NC_019697	CGA	2	6	3158	3163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384228
61	NC_019697	TGGCG	2	10	3320	3329	0 %	20 %	60 %	20 %	434384228
62	NC_019697	GTCA	2	8	3349	3356	25 %	25 %	25 %	25 %	434384228
63	NC_019697	AT	3	6	3452	3457	50 %	50 %	0 %	0 %	434384228
64	NC_019697	GGC	2	6	3488	3493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434384228
65	NC_019697	CGA	2	6	3634	3639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384228
66	NC_019697	GTT	2	6	3643	3648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434384228
67	NC_019697	GCG	2	6	3662	3667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434384228
68	NC_019697	AGGCG	2	10	3683	3692	20 %	0 %	60 %	20 %	434384228
69	NC_019697	CGG	2	6	3715	3720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434384228
70	NC_019697	CG	3	6	3733	3738	0 %	0 %	50 %	50 %	434384228
71	NC_019697	ATG	2	6	3781	3786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384228
72	NC_019697	TG	3	6	3796	3801	0 %	50 %	50 %	0 %	434384228
73	NC_019697	CGG	2	6	3820	3825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434384228
74	NC_019697	CCG	2	6	3871	3876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434384228
75	NC_019697	AATT	2	8	3937	3944	50 %	50 %	0 %	0 %	434384228
76	NC_019697	ACAT	2	8	3998	4005	50 %	25 %	0 %	25 %	434384228
77	NC_019697	TTGC	2	8	4037	4044	0 %	50 %	25 %	25 %	434384228
78	NC_019697	ACC	2	6	4067	4072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434384228
79	NC_019697	CAGA	2	8	4128	4135	50 %	0 %	25 %	25 %	434384228
80	NC_019697	AAT	2	6	4140	4145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384228
81	NC_019697	TTTGGC	2	12	4161	4172	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	434384228
82	NC_019697	A	7	7	4196	4202	100 %	0 %	0 %	0 %	434384228
83	NC_019697	GAA	2	6	4413	4418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434384229
84	NC_019697	AGG	2	6	4478	4483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434384229
85	NC_019697	CCAAC	2	10	4518	4527	40 %	0 %	0 %	60 %	434384229
86	NC_019697	TCG	2	6	4540	4545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384229
87	NC_019697	GGC	2	6	4564	4569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434384229
88	NC_019697	AAT	2	6	4571	4576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384229
89	NC_019697	TAAT	2	8	4591	4598	50 %	50 %	0 %	0 %	434384229
90	NC_019697	ATC	2	6	4621	4626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384229
91	NC_019697	GGA	2	6	4652	4657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434384229
92	NC_019697	AAT	2	6	4771	4776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384230
93	NC_019697	CTT	2	6	4795	4800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434384230
94	NC_019697	TGC	2	6	4821	4826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384230
95	NC_019697	ATGA	2	8	4925	4932	50 %	25 %	25 %	0 %	434384230
96	NC_019697	TCGA	2	8	4977	4984	25 %	25 %	25 %	25 %	434384230
97	NC_019697	GAT	2	6	5014	5019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384230
98	NC_019697	CTG	2	6	5055	5060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384230
99	NC_019697	GGTC	2	8	5109	5116	0 %	25 %	50 %	25 %	434384230
100	NC_019697	TCA	2	6	5161	5166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384230
101	NC_019697	CCT	3	9	5194	5202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434384230
102	NC_019697	CGT	2	6	5222	5227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384230
103	NC_019697	GGC	2	6	5248	5253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434384230
104	NC_019697	GC	3	6	5262	5267	0 %	0 %	50 %	50 %	434384230
105	NC_019697	TAA	2	6	5315	5320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384230
106	NC_019697	AGCG	2	8	5336	5343	25 %	0 %	50 %	25 %	434384230
107	NC_019697	CCG	2	6	5373	5378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434384230
108	NC_019697	CTTGC	2	10	5466	5475	0 %	40 %	20 %	40 %	434384230
109	NC_019697	AAT	2	6	5523	5528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384230
110	NC_019697	AAT	2	6	5646	5651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384230
111	NC_019697	GC	3	6	5692	5697	0 %	0 %	50 %	50 %	434384230
112	NC_019697	CGATT	2	10	5699	5708	20 %	40 %	20 %	20 %	434384230
113	NC_019697	T	6	6	5760	5765	0 %	100 %	0 %	0 %	434384230
114	NC_019697	ATTT	2	8	5778	5785	25 %	75 %	0 %	0 %	434384230
115	NC_019697	TCT	2	6	6052	6057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434384231
116	NC_019697	TGCTC	2	10	6078	6087	0 %	40 %	20 %	40 %	434384231
117	NC_019697	CAGG	2	8	6099	6106	25 %	0 %	50 %	25 %	434384231
118	NC_019697	TC	3	6	6207	6212	0 %	50 %	0 %	50 %	434384231
119	NC_019697	GCT	2	6	6270	6275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384231
120	NC_019697	GTC	2	6	6280	6285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384231
121	NC_019697	A	6	6	6313	6318	100 %	0 %	0 %	0 %	434384231
122	NC_019697	A	6	6	6347	6352	100 %	0 %	0 %	0 %	434384231
123	NC_019697	CTG	2	6	6514	6519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384232
124	NC_019697	T	6	6	6553	6558	0 %	100 %	0 %	0 %	434384232
125	NC_019697	AT	3	6	6570	6575	50 %	50 %	0 %	0 %	434384232
126	NC_019697	TGA	2	6	6586	6591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384232
127	NC_019697	TCT	2	6	6601	6606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434384232
128	NC_019697	TAA	2	6	6612	6617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384232
129	NC_019697	GAT	2	6	6716	6721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384232
130	NC_019697	T	6	6	6765	6770	0 %	100 %	0 %	0 %	434384232
131	NC_019697	TCA	2	6	6778	6783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384232
132	NC_019697	GCT	2	6	6817	6822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384232
133	NC_019697	TAGC	2	8	6851	6858	25 %	25 %	25 %	25 %	434384232
134	NC_019697	TGC	2	6	6875	6880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384232
135	NC_019697	TTA	2	6	6895	6900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434384232
136	NC_019697	TGAA	2	8	6957	6964	50 %	25 %	25 %	0 %	434384232
137	NC_019697	TCGA	2	8	6996	7003	25 %	25 %	25 %	25 %	434384232
138	NC_019697	ATTTC	2	10	7034	7043	20 %	60 %	0 %	20 %	434384232
139	NC_019697	TCGA	2	8	7053	7060	25 %	25 %	25 %	25 %	434384232
140	NC_019697	CTG	2	6	7196	7201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384233
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157	NC_019697	ATAA	2	8	7857	7864	75 %	25 %	0 %	0 %	434384233
158	NC_019697	ATA	2	6	7870	7875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384233
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244	NC_019697	GATCG	2	10	14157	14166	20 %	20 %	40 %	20 %	434384240
245	NC_019697	TAG	2	6	14215	14220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384240
246	NC_019697	CG	3	6	14275	14280	0 %	0 %	50 %	50 %	434384240
247	NC_019697	ACGAT	2	10	14281	14290	40 %	20 %	20 %	20 %	434384240
248	NC_019697	CGA	2	6	14312	14317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384240
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250	NC_019697	GTTT	2	8	14354	14361	0 %	75 %	25 %	0 %	434384240
251	NC_019697	GCC	2	6	14411	14416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434384240
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253	NC_019697	CCG	2	6	14485	14490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434384240
254	NC_019697	GGC	2	6	14516	14521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434384240
255	NC_019697	GAACTA	2	12	14535	14546	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	434384240
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257	NC_019697	T	6	6	14630	14635	0 %	100 %	0 %	0 %	434384240
258	NC_019697	CGA	2	6	14636	14641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384240
259	NC_019697	TGG	2	6	14695	14700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434384240
260	NC_019697	ATG	2	6	14718	14723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384240
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262	NC_019697	CAG	2	6	14811	14816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384240
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264	NC_019697	TTG	2	6	14940	14945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434384240
265	NC_019697	ATGG	2	8	14952	14959	25 %	25 %	50 %	0 %	434384240
266	NC_019697	CAA	2	6	15039	15044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434384240
267	NC_019697	TCG	2	6	15058	15063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384240
268	NC_019697	GTCG	2	8	15097	15104	0 %	25 %	50 %	25 %	434384240
269	NC_019697	GC	3	6	15121	15126	0 %	0 %	50 %	50 %	434384240
270	NC_019697	CGA	2	6	15341	15346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384240
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272	NC_019697	GCTG	2	8	15497	15504	0 %	25 %	50 %	25 %	434384240
273	NC_019697	CGAT	2	8	15546	15553	25 %	25 %	25 %	25 %	434384240
274	NC_019697	GAG	2	6	15573	15578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434384240
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278	NC_019697	TTCG	2	8	15816	15823	0 %	50 %	25 %	25 %	434384240
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282	NC_019697	GGC	2	6	15977	15982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434384240
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299	NC_019697	GTC	3	9	16695	16703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384240
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303	NC_019697	ATCG	2	8	16964	16971	25 %	25 %	25 %	25 %	434384240
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333	NC_019697	CGAT	2	8	18668	18675	25 %	25 %	25 %	25 %	434384242
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342	NC_019697	CTT	2	6	19337	19342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434384242
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344	NC_019697	TAC	2	6	19496	19501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384242
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347	NC_019697	ACCA	2	8	20005	20012	50 %	0 %	0 %	50 %	434384242
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350	NC_019697	TCGA	2	8	20137	20144	25 %	25 %	25 %	25 %	434384242
351	NC_019697	ATCA	2	8	20175	20182	50 %	25 %	0 %	25 %	434384242
352	NC_019697	ACA	2	6	20240	20245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434384242
353	NC_019697	GATC	2	8	20326	20333	25 %	25 %	25 %	25 %	434384242
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360	NC_019697	GT	3	6	21009	21014	0 %	50 %	50 %	0 %	434384243
361	NC_019697	GGAG	2	8	21053	21060	25 %	0 %	75 %	0 %	434384243
362	NC_019697	ATA	2	6	21100	21105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384243
363	NC_019697	T	6	6	21209	21214	0 %	100 %	0 %	0 %	434384243
364	NC_019697	ATG	2	6	21246	21251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384243
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367	NC_019697	CGAT	2	8	21431	21438	25 %	25 %	25 %	25 %	434384243
368	NC_019697	CCG	2	6	21464	21469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434384243
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371	NC_019697	CCCG	2	8	21583	21590	0 %	0 %	25 %	75 %	434384243
372	NC_019697	GCT	2	6	21603	21608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384243
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374	NC_019697	CCA	3	9	21642	21650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434384243
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376	NC_019697	TCCCA	2	10	21685	21694	20 %	20 %	0 %	60 %	434384243
377	NC_019697	AGC	2	6	21887	21892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384243
378	NC_019697	GC	3	6	21907	21912	0 %	0 %	50 %	50 %	434384243
379	NC_019697	GCT	2	6	21999	22004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384243
380	NC_019697	TCG	2	6	22014	22019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384243
381	NC_019697	TGG	2	6	22072	22077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434384243
382	NC_019697	CGG	2	6	22091	22096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434384243
383	NC_019697	AT	5	10	22098	22107	50 %	50 %	0 %	0 %	434384243
384	NC_019697	AGT	2	6	22130	22135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384243
385	NC_019697	CAG	2	6	22144	22149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384243
386	NC_019697	CCA	2	6	22170	22175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434384243
387	NC_019697	CGAT	2	8	22288	22295	25 %	25 %	25 %	25 %	434384243
388	NC_019697	AGT	2	6	22317	22322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384243
389	NC_019697	GCA	2	6	22419	22424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384243
390	NC_019697	A	7	7	22428	22434	100 %	0 %	0 %	0 %	434384243
391	NC_019697	A	6	6	22458	22463	100 %	0 %	0 %	0 %	434384243
392	NC_019697	GAA	2	6	22479	22484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434384243
393	NC_019697	GATC	2	8	22574	22581	25 %	25 %	25 %	25 %	434384244
394	NC_019697	TCAA	2	8	22585	22592	50 %	25 %	0 %	25 %	434384244
395	NC_019697	CTC	2	6	22593	22598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434384244
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